ردیابی مولکولی آستروویروس بوقلمون در استان زنجان، ایران

نوع مقاله : مقاله کامل

نویسندگان

1 گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

2 گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران‎‎

3 بهداشت و بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

چکیده

آستروویروس‌های بوقلمون (TAstV)، به عنوان یکی از عوامل ایجاد سندرم التهاب روده در جوجه بوقلمون‌ها مطرح هستند. هدف از  این مطالعه، بررسی آلودگی تعدادی از گله‌های صنعتی بوقلمون مبتلا به اسهال به آستروویروس‌ها با روش  RT-PCR و به دنبال آن  تعیین توالی ژنوم ویروس‌های ردیابی شده می‌باشد. برای این منظور 30 گله بوقلمون زیر سه هفته با نشانه‌های اسهال و یا چسبندگی مدفوع در اطراف مقعد ازگله‌های بوقلمون استان زنجان انتخاب شدند. از هر گله 10 بوقلمون انتخاب و از روده کوچک آن‌ها نمونه‌گیری انجام گرفت. RT-PCR و سکانس محصول PCR صورت گرفت و ژن پلیمراز نمونه مثبت تعیین توالی نوکلئوتیدی شد. ویروس در 8 گله مثبت ارزیابی شد. توالی‌های به‌دست آمده در این مطالعه با توالی‌های موجود در بانک ژن مقایسه شدند و درخت فیلوژنی بر اساس توالی نوکلئوتیدی بخشی از ژن پلیمراز رسم شد و همه‌ی 8 جدایه به دست آمده در این تحقیق در شاخه آستروویروس بوقلمون 2 (TAstv) قرار گرفتند. سویه‌های بدست آمده بیشترین شباهت را به آستروویروس بوقلمون تیپ 2 سویه‌های لهستانی داشتند. بررسی خصوصیات مولکولی آستروویروس‌های ردیابی شده کمک به شناخت تنوع ژنتیکی این ویروس‌ها نموده و در پیشگیری و کنترل بیماری‌های روده‌ای جوجه بوقلمون‌ها موثر است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Molecular identification of astrovirus in turkey in Zanjan province, Iran

نویسندگان [English]

  • M. Mayahi 1
  • Z. Boroomand 2
  • F. Talazade 2
  • F. Yagane 3
1 Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz; Ahvaz, Iran
2 Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz; Ahvaz, Iran
3 Diseases, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran
چکیده [English]

Turkey Astroviruses (TAstV) is one of the key factors in the emergence of the enteritis syndromes in poults. The aim of this study was to investigate the astrovirus contamination of some industrial turkey flocks with diarrhea in Zanjan province of Iran by RT-PCR and then to determine the genome sequence of the detected viruses. For this purpose, Samples were collected from 30 suspected turkeys' flocks less than 3 weeks ages with clinical signs, diarrhea or fecal pest around vent during 2018-2019. From each suspected flock, randomly ten turkeys were collected and after euthanized, post mortem performed and probable gross lesions were noted in special work sheet. The RT- PCR was performed. The analysis of the nucleotide sequences and their related amino acids was performed. The virus was detected in eight (66/26%) out of 30 flocks.The nucleotid sequences obtained in this study were compared with the sequences in the gene bank and the phylogenetic tree was drawn, ased on the polymerase genes and amino acid sequences obtained from GenBank all eight isolates obtained in this study were in the branch of Astrovirus turkey 2 ( TAstv). These strains most closely resembled the Polish Astrovirus turkey 2 strains.It was concluded that astrovirus play roles in turkeys flock enteritis and farmer should consider prevention and control of turkey's intestinal diseases.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Astrovirus
  • Turkey
  • RT-PCR
  • Iran
1. Barnes, H.J. and J.S. Guy. 2003. Poult enteritis- mortality syndrome. pp.320-326, In: Y.M. Saif, , H.J. Barnes, J.R. Glisson, A.M. Fadly, L.R. McDougald and D.E. Swayne (Eds.), Diseases of poultry, 11th ed. Ames, Iowa State University Press.
2. Canelli, E., P. Cordioli, I. Barbieri, A. Catella, D.Pennelli, and R. Ceruti. 2012. Astroviruses as causative agents of poultry enteritis: genetic characterization and longitudinal studies on field conditions. Avian Diseases 56: 173-82.
3. De wit, J., G. ten Dam, J. van de Laar, Y. Biermann, I. Verstegen, and F. Edens. 2011. Detection and characteriza-tion of a new astrovirus in chicken and turkeys with enteric and. Avian Pathology 40: 453-61.
4. Dea, S. and P. Tijssen. 1988. Viral Agents Associated with Outbreaks of Diarrhea in Quebec. Canadian Journal of Veterinary Research 52: 53-57.
5.Domanska-Blicharz, K., A. Seroka and Z. Minta. 2011. One-year molecular survey of astrovirus infection in turkeys in Poland. Archive of Virology 156:1065–1072.
6. Jackwood, M.J., J.M. Day, M.W. Jackwood and E.Spackman. 2008a. Enteric viruses detected by molecular methods in commercial chicken and turkey flocks in the United States between 2005 and 2006. Avian Diseases 52:235–244.
7. Jackwood, M.J., E. Spackman and J.M. Day. 2008b. Pathogenesis of type 2 turkey astroviruses with variant capsid genes in 2-day-old specific pathogen free poults. Avian Pathology 37: 193-201.
8. Jackwood, M.J., E.Spackman, J.M. Day and D. Rives. 2007. Periodic monitoring of commercial turkeys for enteric viruses indicates continuous presence of astrovirus and rotavirus on the farms. Avian Diseases 51: 674–680.
9. Jindal, N., D.P Patnayak, A.F. Ziegler, A.Lago and S.M. Goyal. 2009. A retrospective study on poult enteritis syndrome in Minnesota. Avian Diseases 53:268–275.
10. Jindal, N., D.P. Patnayak, Y. Chander, A.F. Ziegler and S.M. Goyal. 2010a. Detection and molecular characterization of enteric viruses from poult enteritis syndrome in turkeys. Poultry Sciences 89: 217–226.
11. Jindal, N., D.P. Patnayak, Y.Chander, A.F. Ziegler and S.M. Goyal. 2010b. Detection and molecular characterization of enteric viruses in breeder turkeys. Avian Pathology 39: 53–61.
12. Liu, H. J. and J. Giambrone. 1997. Molecular characterization of avian reovirus using nested PCR and nucleotide sequence analyses. Journal of Virological Methods 65:159-167.
13. Reynolds, D.L. and Y.M. Saif. 1986. Astrovirus: a cause of an enteric disease in turkey poults. Avian Diseases 30:728-735.
14. Reynolds, D.L. and S.L. Schultz-Cherry. 2003. Astrovirus infections. pp.320-326, In: Y.M. Saif, , H.J. Barnes, J.R. Glisson, A.M. Fadly, L.R. McDougald, D.E. Swayne (Eds.), Diseases of poultry, 11th ed. Ames, Iowa State University Press.
15. Roussan, D.A., I.A. Shaheen, G.Y. Khawaldeh, W.S. Totanji and R.H. Al-Rifai. 2012. Simultaneous detection of astrovirus, rotavirus, reovirus and adenovirus type I in broiler chicken flocks. Polish Journal of Veterinary Sciences 15:337-344.
16. Villarreal, L.Y.B., M.S. Assayag, P.E. Brandão, J.L.V. Chacón, A.N.D. Bunger, C.S. Astolfi-Ferreira, C.R. Gomes and R.C. Jones, A.J.P. Ferreira. 2006. Identification of Turkey Astrovirus and Turkey Coronavirus in an Outbreak of Poult Enteritis and Mortality Syndrome. Brazilian Journal of Poultry Science 8: 131 – 135.