فیلوژنی سویه‌های واکسن مایکوپلاسما آگالاکتیه موجود در ایران با استفاده از روش (Multi Locus Sequence typing (MLST

نوع مقاله : مقاله کامل

نویسندگان

1 گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران

2 دکترای تخصصی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

چکیده

مایکوپلاسما آگالاکتیه یکی از عوامل اصلی ایجاد آگالاکسی در نشخوارکنندگان کوچک می‌باشد. ایران یکی از کانون‌های اصلی اپیدمی‌های سالانه این بیماری در جهان شناخته می‌شود. واکسن کشته آگالاکسی با استفاده از سه سویه بومی شیراز، طالقان و لرستان در موسسه رازی تولید می‌شود. به منظور شناسایی ویژگی‌های ژنتیکی این سویه‌ها سیستم تایپینگMulti Locus Sequence typing (MLST)i با تمرکز بر روی 5 ژن dnaA ،gltX ،gyrB ، metS و tufA و بر اساس پروتکل پیشنهادی بانک بین‌المللی MLST م. آگالاکتیه اجرا گردید. بر اساس نتایج بدست آمده هر سه سویه در لوکوس dnaA آلل 1 ، در لوکوس gltX آلل 21، در لوکوس gyrB آلل ،2 در لوکوس metS آلل 2 و در لوکوس tufA آلل 1 را ارائه نمودند. در لوکوس gltX آلل مربوط به سه سویه ایرانی جدید و بدون سابقه گزارش قبلی شناسایی گردید. بدین ترتیب یک تیپ ژنتیکیsequence type (ST33)3 جدید با شباهت زیاد به ST4 که پیش از این در بانک بین المللی MLST ثبت شده است شناسایی گردید. ما معتقدیم ویژگی‌های پرورش دام در ایران اقتضا می‌نماید که کمپلکس یا کمپلکس‌های کلونال بومی م. آگالاکتیه در فضای جغرافیایی ایران انتشار داشته باشند.

کلیدواژه‌ها

موضوعات

عنوان مقاله [English]

Phylogeny of Mycoplasma agalactiae vaccine strains in Iran, a molecular study based on multilocus sequence typing

نویسندگان [English]

  • Kh. Kabiri 1
  • K. Tadayon 2
  • S.A. Pourbakhsh 2
  • Jamileh Nowroozi 1
1 Department of Microbiology, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran.
2 Agricultural Research, Education and Extention Organization (AREEO), Razi Vaccine and Serum Research Institute, Karaj, Iran.
چکیده [English]

Mycoplasma agalctiae (Ma) is a principle agent in etiology of agalaxy. Iran remains a major world stronghold for agalaxy with numerous annual outbreaks. Three indigenous Ma strains of Lorestan, Taliqan and Shiraz are used in preparation of agalaxy vaccine at Razi institute. In order to characterize genetic properties of these strains a MLST genotyping system consisting of five genes (dnaA, gltX, gyrB, metS, tufA) based on guidelines recently developed was employed. In consequence, at dnaA, gltX, gyrB, metS and tufA loci of all the three strains alleles 1, 21, 2, 2 and 1 were identified, respectively. The gltX allele (21) was shown to be new with no previous record in the MLST database. A new sequence type (ST33) with close similarity to ST4 was assigned to these stains. Given the characteristics of the Iranian animal farming sector, we assume circulation of more clonal complex or complexes of Ma in the Iranian environment is expectable.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Mycoplasma agalactia
  • Agalaxy
  • MLST
  • Clonal complex
  • Sequence type

مراجع

1. Manso-Silvan, L., et al., Phylogeny and molecular typing of Mycoplasma agalactiae and Mycoplasma bovis by multilocus sequencing. Vet Microbiol, 2012. 161(1-2): p. 104-12.
2. McAuliffe, L., et al., Multilocus sequence typing of Mycoplasma agalactiae. Journal of Medical Microbiology, 2011. 60(6): p. 803-811.
3. Sotoodehnia, A., et al., Preparation of agalactia vaccine in fermentor. Archives of Razi Institute, 2007. 62(1): p. 45-48.
4. Bory, G. and F. Entessar, Etude analytique de l'immiunopro- phylaxie de l'agalaxie contagieuse des chevres et des moutons. Arch. Inst. Razi, 1959. 11: p. 5.
5. Watson, W., et al., The pathogenicity of mycoplasma organisms isolated from sheep and goats in Turkey. Journal of Comparative Pathology, 1968. 78(3): p. 283-291.
6. Al-aubaidi, J.M., A.H. Dardiri, and J. Fabricant, Biochemical characterization and antigenic relationship of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides, Freundt and Mycoplasma mycoides subsp. capri (Edward) Freundt. Int J Syst Evol Microbiol, 1972. 22(3): p. 155-164.
7. Baharsefat, M., B. Yamini, and P. Ahourai, Mycoplasma agalactiae. V. Comparison of three different contagious agalactia vaccine. Inst Razi Arch, 1971. 23: p. 6.
8. Kheirabadi, K. and A. Ebrahimi, Investigation of Mycoplasma agalactiae in milk and conjunctival swab samples from sheep flocks in west central, Iran. Pakistan Journal of Biological Sciences: PJBS, 2007. 10(8): p. 1346-1348.
9. Kheirkhah, B., et al., The molecular characterization of Mycoplasma agalactiae isolates from Iranian goats when compared with other Iranian isolates and vaccinal strains. African Journal of Microbiology Research, 2013. 7(4): p. 324-329.
10. Khezri, M. and S. Pourbakhsh, A survey of Mycoplasma agalactiae in small ruminants with contagious agalactiae syndrome in Iran. Bangladesh Journal of Veterinary Medicine, 2014. 12(1): p. 67-72.
11. Nouvel, L.X., et al., Molecular typing of Mycoplasma agalactiae: tracing European-wide genetic diversity and an endemic clonal population. Comp Immunol Microbiol Infect Dis, 2012. 35(5): p. 487-96.
12. Nouvel, L.X., et al., Comparative genomic and proteomic analyses of two Mycoplasma agalactiae strains: clues to the macro- and micro-events that are shaping mycoplasma diversity. BMC Genomics, 2010. 11: p. 86.
13. McAuliffe, L., R.D. Ayling, and R.A. Nicholas, Identification and characterization of variable-number tandem-repeat markers for the molecular epidemiological analysis of Mycoplasma mycoides subspecies mycoides SC. FEMS Microbiol Lett, 2007. 276(2): p. 181-8.
14. Maiden, M.C., et al., Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. Proc Natl Acad Sci USA, 1998. 95(6): p. 3140-5.
15. Jolley, K.A., M.S. Chan, and M.C.J. Maiden, MLSTdbNet–distributed multi-locus sequence typing (MLST) databases. BMC Bioinformatics, 2004. 5(1): p. 86.
16. Subramaniam, S., et al., Species identification of Mycoplasma bovis and Mycoplasma agalactiae based on the uvrC genes by PCR. Mol Cell Probes, 1998. 12(3): p. 161-9.
17. Stucky, B.J., SeqTrace: a graphical tool for rapidly processing DNA sequencing chromatograms. J Biomol Tech, 2012. 23(3): p. 90-3.
18. Li, W., et al., The EMBL-EBI bioinformatics web and programmatic tools framework. Nucleic Acids Res, 2015. 43(W1): p. W580-4.
19. Manso-Silván, L., et al., Phylogeny and molecular typing of Mycoplasma agalactiae and Mycoplasma bovis by multilocus sequencing. Vet Microbiol, 2012. 161(1): p. 104-112.
20. Mayor, D., et al., Multilocus sequence typing (MLST) of Mycoplasma hyopneumoniae: a diverse pathogen with limited clonality. Vet Microbiol, 2008. 127(1-2): p. 63-72.
21. Tocqueville, V., et al., Multilocus sequence typing of Mycoplasma hyorhinis strains identified by a real-time TaqMan PCR assay. J Clin Microbiol, 2014. 52(5): p. 1664-71.
22. Brown, R.J., et al., Development of a multilocus sequence typing scheme for molecular typing of Mycoplasma pneumoniae. J Clin Microbiol, 2015. 53(10): p. 3195-203.
23. El-Gazzar, M., et al., Development of Multilocus Sequence Typing (MLST) for Mycoplasma synoviae. Avian Dis, 2017. 61(1): p. 25-32.
24. Mahdavi, S., et al., Comparative study of homology of cytoplasmic membrane protein 40 KDa of Mycoplasma agalactiae in isolated strains in Iran. African Journal of Microbiology Research, 2009. 3(9): p. 528-532.

فایل ها

سابقه مقاله

  • تاریخ دریافت: 29 خرداد 1396
  • تاریخ بازنگری: 11 مرداد 1396
  • تاریخ پذیرش: 15 مهر 1396

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار